В анимационном фильме "Мегамозг" рассказывается история инопланетянина с голубой кожей и гигантской головой, который с детства соперничает с другим пришельцем – Метро-Мэном. Пока Метро-Мэн стал величайшим героем города, Мегамозг превратился в его главного злодея, постоянно терпя поражения. Однако всё меняется, когда Мегамозгу неожиданно удаётся победить своего заклятого врага. После триумфа город оказывается в его руках, но вместо радости от победы, он ощущает пустоту – без достойного противника его злодейское существование теряет смысл.

Пытаясь вернуть прежнее равновесие, Мегамозг создаёт нового супергероя, но эксперимент идёт не по плану. Параллельно с этим он влюбляется в репортёра Роксану Ричи, ради которой начинает притворяться обычным человеком. Когда его созданный герой превращается в настоящего злодея, угрожающего городу и Роксане, Мегамозг оказывается перед сложным выбором. Возможно, тот, кого все считали злодеем, на самом деле способен стать героем и найти своё настоящее предназначение.

В мире, оплакивающем смерть Супермена, на плечи Бэтмена ложится тяжелая ноша защитника человечества. Столкнувшись с необычным созданием — парадемоном, Брюс Уэйн понимает, что надвигается угроза вселенского масштаба. Это понимание заставляет его отправиться на поиски исключительных людей с уникальными способностями, чтобы сформировать команду, способную противостоять грядущей опасности.

Тем временем древний враг человечества Степпенвульф возвращается на Землю с единственной целью — завершить миссию, в которой он потерпел поражение тысячи лет назад. Он стремится собрать три могущественные Материнские шкатулки, разделённые между амазонками, атлантами и людьми, чтобы создать разрушительное Единство. Если ему это удастся, планета будет терраформирована, а жизнь на ней уничтожена. Перед лицом такой угрозы супергерои должны объединиться, несмотря на все различия, чтобы спасти мир, который, возможно, уже потерял свою самую яркую надежду.