История разворачивается на бывшем рыболовном судне, перестроенном в космический корабль Bebop. Здесь собралась разномастная команда изгоев, у каждого из которых в прошлом немало тайн. Джет Блэк — экс-полицейский и бывший киборг. Дерзкий молодой и горячий Спайк Шпигель прежде занимался преступной деятельностью. Поначалу эти двое странствовали в компании друг друга, разбрасывая по всей вселенной сети для поимки «дорогостоящих» нарушителей закона. Но вскоре экипаж пополнился амнезиальной крио-пациенткой Фэй Валентайн — милой любительницей игры в карты.

Девушка, задолжавшая немалую сумму, скрывается от преследователей, желающих вернуть свои деньги. Эдвард — талантливая хакерша с неординарным умением работать с компьютерами, при этом не относящаяся к секвестрам. Эйн — генно-инженерный сверхинтеллектуальный валлийский корги. Охотники за головами, постоянно паря над крайней нищетой, преследуют преступников во всей Солнечной системе. Ковбои находятся в непрекращающемся поиске ремонта корабля и периодическом пополнении еды и боеприпасов. По пути они пытаются узнать как можно больше о прошлом Фэй, ликвидируют отвратительные тупики, висящие за Спайком, и закрывают дела, которые Джет начал в те времена, когда он был сотрудником правоохранительных органов.

Добродушный средневозрастной учитель музыки одной из нью-йоркских школ, Джо Гарднер, обожает джаз. Мужчина, всю свою сознательную жизнь мечтал стать известным исполнителем, чтобы получить возможность выступать на лучших площадкам мира. Однажды, у главного героя появился отличный шанс осуществить задуманное. На прослушивании в престижном клубе, своей игрой он впечатлил признанную звезду эстрады, Доротею Уильямс.
Возвращаясь в прекрасном настроении домой, Джо проваливается в открытый канализационный люк и трагически погибает. Очнувшаяся в параллельной реальности бестелесная душа, ищет способ вернуться в мир живых. Спустя некоторое время, Гарднер знакомится с упрямым духом, под название «22». Новоявленных приятелей объединяет большое количество общих интересов. Музыкант собирается приложить максимум усилий, чтобы возвратиться на Землю до того момента, пока его физическое тело окончательно не умерло. Но прежде, он должен пройти массу непростых испытаний...