В центре сюжета мультфильма "Босс-молокосос" находится семилетний мальчик Тим Темплтон, чья идеальная жизнь единственного ребёнка в семье внезапно рушится с появлением необычного младшего брата. Новый член семьи – это не обычный младенец, а настоящий "босс" в миниатюре: он носит деловой костюм, повсюду таскает с собой портфель и, когда рядом нет взрослых, разговаривает басистым голосом. Тим быстро понимает, что с малышом что-то не так, и начинает наблюдать за ним.

Оказывается, этот необычный младенец – агент секретной организации BabyCorp, отправленный с особой миссией. Эта корпорация выясняет, что их главный конкурент – компания PuppyCo – готовится выпустить невероятно милого щенка, который может отвлечь любовь родителей от малышей во всём мире. Несмотря на изначальную вражду, Тим и Босс-молокосос вынуждены объединиться, чтобы предотвратить этот коварный план. Впереди их ждут невероятные приключения, опасные миссии и, что самое важное, осознание настоящей ценности семейных уз, о чем никто из них даже не подозревал в начале своего знакомства.

Дороти и Шон Тернеры пережили невообразимую трагедию: их долгожданный сын Джерико ушел из жизни, когда ему было всего несколько месяцев. Герои многогранной драматической истории "Дом с прислугой" погрузились в мрак горя, и только профессиональный психотерапевт предложил им необычный способ справиться с потерей. Заменить утраченное счастье на реалистичную куклу-младенца. Этот совет оказался неожиданно эффективным, и исцеляющая сила этой куклы-реплики помогла Дороти начать восстанавливать свою жизнь. Она уделяет маленькому "Джерико" всю свою заботу, и такой подход помогает ей возвратиться к нормальной жизни. Но когда приходит время вернуться к работе, Дороти решает пригласить няню для Джерико...

В их доме появляется Линн, молодая женщина, которая удивительно легко принимает на себя заботу о кукле. На удивление Линн воспринимает Джерико как настоящего ребенка и проявляет к нему невероятную заботу, не только в присутствии Дороти. Это начинает вызывать настороженность у Шона, мужа Дороти. Все больше вещей кажется странными, и внезапно, кукла оказывается настоящим ребенком! Вопрос, откуда он взялся и что это значит, остается без ответа.

С новым поколением появляются новые злодеи. Тед и Тим братья, пережившие очень много сложностей вместе, с возрастом отдалились друг от друга. Теда интересовало личное благополучие, и он подался в бизнес и стал отличным директор инвестиционного фонда. У Тима же всё сложилось куда интересней, женившись и поселившись в пригороде в скором времени у него появились две прелестные дочки Тина и Табита. Семилетняя Табита несмотря на свой ранний возраст лучшая ученица в классе, и прекрасный пример на кого стоит равняться. Вскоре же оказывается, что её сестра Тина является тайным агентом компании BabyCorp.

Она намерена противостоять злому доктору Эрвину Армстронгу. Его цель растить зловещих карапузов. Когда тайна Тины была раскрыта, жизнь её папы и дяди кардинально меняется. Им предстоит помочь ей остановить зло. Чтобы разобраться в подробностях, что за заговор происходит в компании, и кто хочет её разрушить, да и найти слабое звено своего врага им снова придётся вернуться в организацию BabyCorp и вспомнить старые временна. Но есть небольшая проблема в виде взрослого человека их туда не пустят. Решения долго ждать не пришлось. Выпив таблетки, делающие их младенцами, они отправились бороться с немалым злом.