В центре сюжета «Восстания планеты обезьян» находится молодой ученый Уилл Родман, разрабатывающий революционное лекарство от болезни Альцгеймера. В ходе экспериментов на шимпанзе он обнаруживает, что препарат не только лечит нейродегенеративные заболевания, но и значительно повышает интеллект. Когда Уилл забирает к себе детёныша шимпанзе, называя его Цезарем, он и не подозревает, что растит существо, чей разум вскоре превзойдёт человеческий, и чья судьба изменит будущее всей планеты.

По мере взросления, Цезарь начинает осознавать жестокость мира людей и своё положение в нём. Столкнувшись с несправедливостью и оказавшись в заточении среди других обезьян, он постепенно превращается из испуганного животного в харизматичного лидера. Цезарь планирует дерзкий побег и последующее восстание, которое станет не просто бунтом против угнетателей, но первым шагом к формированию новой цивилизации, где обезьяны больше не будут подчиняться людям.